Sie war vom Mai 1949 bis zum Februar 1985 im Gebäudekomplex des ehemaligen Militärgefängnisses in der Lehrter Straße 6061 untergebracht. Das Berliner Frauengefängnis in der Barnimstraße 10 (Friedrichshain) war nach der Teilung Berlins 1948 nicht mehr für West-Berlin verfügbar. So wurde in dem wenig zerstörten Gebäudekomplex in der Lehrter Straße 60/61 nach Instandsetzungsarbeiten ab 15. 5 1949 eine Frauenstrafanstalt eingerichtet. Als von 1965 bis 1970 die Zahl der weiblichen Gefangenen in Berlin von 214 auf 96 zurückging, wurde zudem die Jugendvollzugs- und Untersuchungshaftanstalt für Frauen in das Gefängnis eingegliedert. Ab 1970 waren hier auch Frauen aus der Baader-Meinhof-Gruppe inhaftiert. 1976 gelang es vier dieser Frauen, aus der Vollzugsanstalt auszubrechen. Der damalige Justizsenator Hermann Oxfort mußte daraufhin zurücktreten. Im Frühjahr 1985 übersiedelte die J. in einen Neubau am Friedrich-Olbricht-Damm (Charlottenburg).